植髮手術為醫學美容手術，故可能會有副作用產生，視個人情況有異，不一定會發生，以下為術後復原期可能發生的情況：
(一)術後臉部水腫：
術後3-5天為水腫高峰期；術後7-14天水腫會消退，術後請勿長時間低頭，以減緩術後水腫狀況。若水腫較嚴重有可能會產生眼周瘀青情形(機率很小)。
(二)術後毛囊炎/痘痘：
手術部位偶爾會因毛髮阻塞毛孔而出現毛囊炎/痘痘，約術後1-3個月內會出現。可以擦拭消炎藥膏或痘痘素減緩。
(三)術後頭部感覺異常：
手術時有可能會損傷微小末梢神經而產生感覺異常是屬正常現象，約3-6個月會恢復。
(四)手術引起的暫時性掉髮Shock Loss：
- 植髮區周圍原有毛髮，因植入新的毛囊，而原有毛髮養分供給不足而產生掉髮情形。
- 取髮區周圍原有毛髮，部分不太健康毛髮會直接進入休止期而產生掉髮情形。
- 除上述2點外，仍有不明原因會產生手術引起暫時性掉髮情形。
- 男女生發生機率是一樣的
- 手術引起暫時性掉髮，通常發生在術後3週，約3-6個月掉髮部分會重新長出。
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